Aminokislotalar tuzilishiga ko’ra alifatik (ochiq zanjirli), aromatik (xalqali) va geterotsiklik aminokislotalarga bo’linadi. Ular fizik va kimyoviy xususiyatlariga ko’ra neytral, kislotali va ishqoriy guruhlarga bo’linadi. Aminokislotalar tarkibida qo’shimcha funksional guruhlar tutishiga qarab, dikarbon, diamin aminokislotalar, oksiaminokislotalar, oltingugurt tutuvchi aminokislotalar va boshqa guruhlarga bo’linadi. Hayvon to’qimalarida, o’simliklarda va mikroorganizmlarda 300 dan ortiq erkin aminokislota borligi aniqlangan. Lekin oqsillar tarkibida faqat 20 ta (-aminokislota va ularning ikkita amidi uchraydi. Oqsillar tarkibiga kiradigan aminokislotalar keltirilgan.