Innovatsion faoliyatni rag'batlantirish samarali tizimi turli xil moliyaviy, huquqiy, infratuzilmaviy, ta'limiy, axborot-maslahat va madaniy usullarni o'z ichiga oladi. Har bir usul innovatsion ekotizimning muayyan elementlariga ta'sir ko'rsatadi va ularning o'zaro hamkorligini kuchaytirishga qaratiladi.