Maxsus audit topshiriqlari auditorlik jarayonida maxsus ko‘rsatmalar asosida amalga oshiriladigan topshiriqlardir. Bu topshiriqlar odatda korxona rahbariyati yoki boshqaruv organlari tomonidan belgilangan aniq maqsadlarga erishishni ta’minlashga qaratilgan bo‘ladi.