Sekvenirlash natijasida olingan ma'lumotlarni qayta ishlash bioinformatikaning asosiy vazifasi. Genlarni solishtirish orqali oqsillar vazifasi yoki turlar o'rtasidagi munosabatni aniqlash mumkin. Kompyuter dasturlari genomlardagi o'xshash DNK ketma-ketliklarini taqqoslaydi.