Mikroorganizmlar biotexnologiyada fermentlar, antibiotiklar, vaksinalar va fermentatsiya mahsulotlarini ishlab chiqarishda asosiy rol o'ynaydi. Ular genetik muhandislikda rekombinant oqsillar va metabolik yo'llarni modifikatsiya qilish uchun xost sifatida xizmat qiladi