Mikroorganizmlarning zamonaviy sistematikasiga kirish: bu mikroorganizmlarni tasniflash, identifikatsiya va filogenetik munosabatlarini aniqlash fanidir. Maqsadlar: taksonomiyani yangilash, evolyutsion aloqalarni aniqlash, identifikatsiya va nomenklaturani standartlashtirish. Usullar: fenotipik analizlar, 16S rRNA sekvenirlash, genomik analizlar, butun genom sekvenirlash (WGS), gen bo'yicha ANI va dDDH hisoblash. Yondashuv: polifazik taksonomiya. Ahamiyati: tibbiyot, ekologiya va biotexnologiyada mikroorganizmlarni to'g'ri aniqlash va klassifikatsiyalash