Fazaviy kontrast mikroskopiyasi biologiya, tibbiyot, biokimyo sohalarida, xususan, hujayra biologiyasi va sitologiyada 100x dan 1000x gacha bo'lgan kattalashtirish darajalarida keng qo'llaniladi. Fazaviy kontrast mikroskopiyasi tirik hujayralarni, masalan, 5-10 mkm o'lchamdagi bakteriyalarni, ularning ichki tuzilmalarini buzmasdan kuzatishda keng qo'llaniladi, chunki bu usul bo'yashni talab qilmaydi. Zamonaviy mikroskopiya usullarining rivojlanishi 3D tasvirlash imkoniyatlarini 10 barobarga oshirdi va kelajakda 100 nm dan kam bo'lgan ob'ektlarni aniq kuzatishga imkon beradi.