Gipotalamus organizmning uyqu, tana harorati, ishtaha, stressga javob va gormonal balans kabi muhim fiziologik jarayonlarini boshqaradi. U gipofiz beziga ta'sir qilib, turli gormonlarning chiqarilishini boshqaradi, jumladan, o'sish gormoni, tiroksin va kortizol