Zamonaviy Kristallografiya 5 ta asosiy boʻlimlarga boʻlinadi: geomeetrik kristallografiya - kristallarning simmetriya, struktura va morfologiyasini oʻrganadi; kristallogenez - kristallarning hosil boʻlishi va oʻsishi ni tekshiradi; kristallofizika - kristallarning optik, elektr, mekhanik, magnit va boshqa xossalarini tadqiq qiladi; kristalloximiya - kristallarm moddalarning kimyoviy tarkibi, strukturasi, xossalari va morfologiyalari orasidagi bogʻlanish qonuniyatlarini oʻrganadi.