Xatarlarni baholash va tahlil qilish metodologiyalari innovatsiyalarni joriy etishda xatarlarni aniqlash, tasniflash, baholash va nazorat qilishni o'z ichiga oladi. Metodlar: sifatli (ekspert bahosi, SWOT, manfaatdor tomonlarni xaritalash), miqdoriy (FMEA, Monte-Karlo simulyatsiyasi, ehtimollik-ta'sir matrisi, sezgirlik tahlili, fault tree, bow-tie), xatarlar reestri va prioritetlashtirish, senariy tahlili, erta ogohlantirish indikatorlari, monitoring va takroriy baholash orqali mitigatsiya strategiyalarini optimallashtirish