Organik birikmalarning molekula geometriyasi kimyoviy birikmalarning fazoviy tuzilishini o'rganadi. Molekulalarning geometriyasi VSEPR (Valence Shell Electron Pair Repulsion) modeli orqali aniqlanadi, bu esa atomlar va elektron juftlar orasidagi repellentsiyani hisobga oladi. Tetraedral, uchburchakli planar va liniyada joylashish eng keng tarqalgan geometriyalar hisoblanadi