Mamlakatda terrorizmga qarshi kurashda maxsus kuchlarning roli muhim boʻlib, ularning tayyorgarligi va jihozlanishiga 500 million dollardan ortiq mablagʻ sarflangan. Oʻzbekiston 2000-yillarning boshlarida “Islomiy Harakat” kabi ekstremistik guruhlarga qarshi keng koʻlamli operatsiyalar oʻtkazdi, natijada yuzlab jangarilar yoʻq qilindi yoki hibsga olindi.