Uzbekiston Mustaqilligi e'lon qilinishidan so'ng, 1992 yil yanvar oyida O'zbekiston askari qo'shnilarini tashkil etdi. Sovet Ittifoqi tfalanlarini O'zbekiston hududiga ko'chirilgan, tashkil etilgan yoki chiqarilgan. 1992–1993 yillarda Mudofaa vaziri va konksriptsiya tizimi yaratildi. 1990 yillarida va 2000 yillarda askari qo'shni islohot qilindi va professionalizatsiyalashdi, hududiy himoya, chegaralar xavfsizligi va kontrteroristikani rag'batlantirdi