Chuqur mikoz — bu qo'ziqorinlar tomonidan chaqiriladigan, terining chuqur qatlamlari, teriosti to'qimalari va ba'zan ichki organlarga ta'sir qiluvchi og'ir infeksiyalar turidir. Bu kasallik odatda immuniteti pasaygan odamlarda yoki chuqur jarohatlangan to'qimalarga yuqtiruvchi mikroorganizmlar kirganda rivojlanadi. Chuqur mikozlarning eng keng tarqalgan turlari: 1. Histoplazmoz – Histoplasma qo'ziqorinlari sabab bo'ladi va asosan nafas yo'llariga ta'sir qiladi. 2. Blastomikoz – Blastomyces dermatitidis qo'ziqorini sababli paydo bo'ladi va nafas olish tizimini hamda terini zararlashi mumkin. 3. Koksidioidomikoz – Koksidioid qo'ziqorini tomonidan chaqiriladi va asosan nafas yo'llari orqali kiradi 4. Kandidiyoz – Candida qo'ziqorinlari asosan ichki organlarga ta'sir ko'rsatadi, ayniqsa immunitet zaif bo'lganda.