Patofiziologiyaning asosiy vazifasi inson organizmida uchrovchi turli patologik jarayonlar va kasalliklarning kelib chiqish sabablari, ularga turtki beruvchi ichki va tashqi shart-sharoitlar, rivojlanish mexanizmlari, kasallik kechishi, a'zo va to‘qimalar faoliyatining o‘zgarishlari hamda kasallik asorat va oqibatlarini o‘rganish.